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入力ファイルの作り方
Excel または CSV で、以下のような表を作ってください:
Gene | Sample1 | Sample2 | Sample3 | ...
AQP4 | 50.2 | 48.1 | 52.3 | ...
CALB1 | 30.1 | 28.5 | 32.0 | ...
1列目が遺伝子名、2列目以降が各サンプルの発現量(FPKM/TPM)です。
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📂
CSV / TSV / Excel (.xlsx)
2
入力ファイルの作り方
サンプルIDと診断群(Dx)の列があるテーブルです。列の順番は自由です:
ID | Dx | Age | Sex | ...
Sample01 | Control | 45 | M | ...
Sample02 | Schizo | 41 | F | ...
Age, Sex, BMI などの列があれば、Figure の横軸に使えます。
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📂
Excel (.xlsx) / CSV
3
— 入力ファイルの作り方
お手持ちのDEGリストがそのまま使えます。遺伝子名とFold Changeの列があればOK:
Symbol | Fold Change | P-Value(あれば) | ...
AQP4 | 224.5 | 6.63E-20 | ...
CALB1 | -40.2 | 1.10E-06 | ...
列の順番は自由。P-ValueやRank列は無視されます。FC形式(Ratio/Log2FC等)は自動判定。
遺伝子リストだけ(Fold Changeなし):
方向性なしの enrichment スコアとして計算されます。
テンプレートをダウンロード
📂
CSV / TSV / Excel — Symbol, Fold Change 形式(複数可)
4
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Figures
Figureの横軸を変更できます →
サンプル情報の列から選択(数値→散布図、カテゴリ→箱ひげ図に自動切替)
Advanced: Figure Settings
Width (px)
Height (px)
Scale (DPI)
1x (72dpi)
2x (144dpi)
3x (216dpi)
4x (288dpi)
Font size
Title font
Font family
Arial
Helvetica
Times New Roman
IBM Plex Sans
Axis label X
Axis label Y
Marker size
Dx colors:
Apply & Redraw
⬇
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Methods text
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