村野友幸 Tomoyuki Murano

ソフトウェア・データ

RFind-sc

各細胞を、外部の遺伝子シグネチャで定めた生物学的な軸の上に位置づける解析手法（bioRxiv 2026）。

• RFindsc — R パッケージ（Seurat 用）GitHubZenodo v1.0.1MIT ライセンス
• rfindsc — Python パッケージ（AnnData 用。R パッケージと同じ計算結果になります）GitHubZenodo v1.0.1MIT ライセンス
• RFind-sc 論文の解析コードGitHubZenodo v1.0.2MIT ライセンス
• Shi ら（2026）の生体内・全脳 Perturb-seq アトラスから作った、ノックアウトごとの疑似バルク発現プロファイルZenodo データセットCC BY 4.0

REPOPS（反復光遺伝学刺激）

• 村野ら Nature Communications 2026 の解析コードと処理済みデータGitHub元データ（SSBD）

歯状回の集団符号化

• 村野ら PNAS 2022 のカルシウムイメージング元データSSBD リポジトリ